Composé des membres des différents conseils des caisses d'assurances maladie de la région, le Conseil règle par ses délibérations les affaires de l'Urcam. Assistent également au Conseil, le directeur de la Direction régionale des affaires sanitaires et sociales, le directeur de l'Agence régionale de L'hospitalisation, les médecins conseils régionaux des trois régimes, et le Service régional de l'inspection du travail , de l'emploi et de la protection sociale agricole.
Le conseil :
- oriente l'activité de l'Union et se prononce sur le ou les rapports qui lui sont remis par le directeur, notamment sur ceux relatifs à ses activités administratives et financières,
- adopte un rapport annuel présentant les résultats de la gestion du risque par les caisses et organismes membres de l'Union,
- établit les statuts et le réglements intérieur de l'Union,
- arrête le compte financier après avoir entendu l'agent comptable,
- approuve, sur proposition du directeur, les budgets de gestion et d'intervention établis dans le respect du contrat pluriannuel d'objectifs et de gestion conclu entre l'organisme et l'Union nationale mentionnée à l'article L. 182-2-1.